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JOE 亚磷酰胺，6-异构体 (JOE phosphoramidite, 6-isomer)

OE 亚磷酰胺，用于寡核苷酸合成，纯6-异构体 (6-JOE)。 荧光染料JOE是一种含有两个氯原子和两个甲氧基的荧光素衍生物。其最大吸收和最大发射波长分别为 503 nm 和 525 nm。从其光谱特性来看，由于JOE 介于 FAM 和 TAMRA/ROX 之间；因此，这种荧光团通常用于多重检测，包括 DNA 测序期过程中的多重检测。 我们的目录还包含 JOE 亚磷酰胺，5-异构体。我们比较了含有不同 JOE 异构体（5-JOE 和 6-JOE）的 qPCR 探针，发现它们之间没有显着差异。 用法 耦合：6分钟 脱保护：标准条件下使用氢氧化铵；脱保护时间取决于寡核苷酸组成和核碱基保护基团（在 55 °С 下脱保护 17 小时，可去除标准核碱基上的所有保护基团）。可与AMA（30% 氢氧化铵/40% 甲胺水溶液，1:1 v/v）一起使用，伴随5% 的非荧光副产物的形成。为了避免副产物的形成，采用氨水脱保护（室温下 30 分钟），添加等体积的 40% 甲胺水溶液，继续用 AMA 按要求脱保护（例如65 °C 下 10 分钟）。